Los expertos de la Universidad Pablo de  Olavide tienen la capacidad de hacer análisis de datos biológicos para predecir la función de secuencias proteicas específicas, o  bien de genes concretos cuyas anotaciones no son conocidas, a través de herramientas computaciones basadas en minería de datos. 

Además los científicos están en disposición de desarrollar herramientas bioinformáticas que permitan predecir la función de la proteína que es codificada por un gen huérfano, es decir un gen completamente desconocido, que no se parezca a otro conocido previamente.

• Estos análisis podrían tener su uso para describir en detalle las características de genes ligados a determinadas enfermedades y descubrir nuevo conocimiento que pueda ayudar a la investigación y tratamientos para su prevención o cura.
• Comprender mejor las consecuencias de las mutaciones que afectan a determinados genes y las proteínas asociadas, para los que se espera encontrar y anotar sus regiones y posiciones esenciales, describir su conjunto de patrones y motivos, ayudándose del estudio de homólogos de otros organismos.
• Una de las aplicaciones podría ser el análisis bioinformático de los genes y proteínas relacionados con patogénesis de enfermedades humanas. Así, los expertos son capaces de llevar a cabo diversos análisis bioinformáticos para describir en detalle las características del gen ligado con la enfermedad, y descubrir nuevo conocimiento que pueda ayudar a la investigación experimental y aplicada. 
• Aportar nueva información de la función de genes huérfanos que nunca antes habían sido estudiados.
• Predecir la estructura 3D de proteínas de interés y ligar los resultados con información funcional.

Estos análisis se llevarían a cabo localizando homólogos de secuencia en otras especies y realizando alineamientos múltiples para estudiar la conservación de aminoácidos.  Además, se consultarían bases de datos útiles para describir la función de proteínas como UniProt, Pfam o Prosite. Adicionalmente, se utilizarían herramientas más específicas para la anotación de secuencias desconocidas como AnaGram.

• Un ejemplo de herramienta desarrollada por el investigador responsable es el servidor web AnaGram, que se complementa con el uso de otras herramientas bioinformáticas que no son propias: http://chirimoyo.ac.uma.es/anagram/. Además está la herramienta KAT, que va orientada en la misma línea: http://coot.embl.de/kat/
• En colaboración con un grupo de científicos del Hospital Virgen del Rocio de Sevilla, el investigador responsable  predijo la estructura 3D de una proteína del SIDA -Flor Parra et al. 2010-): http://www.bioinfocabd.upo.es/publicaciones.htm

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Grupo de Bioinformática UPO-CABD. Area de Genética. Departamento de Biología Molecular e Ingeniería Química  > Más ofertas de este grupo