Instituto propio del CSIC perteneciente al Área de Recursos Naturales. Creado en 1947 con el nombre de Instituto de Aclimatación de Almería, en 1975, cambió su denominación a la actual de EEZA. Combina el desarrollo de investigación básica y aplicada con la prestación de formación especializada, asesoramiento e información acerca de los conocimientos y orientaciones metodológicas necesarias para mejorar la gestión del medio natural y rural en ambientes extremos. Está estructurado en dos departamentos: el Departamento de Desertificación y Geoecología y el Departamento de Ecología Funcional y Evolutiva. Destaca por sus elevados índices de productividad científica y por su captación de fondos.