{"id":30858445,"date":"2019-10-23T12:41:23","date_gmt":"2019-10-23T10:41:23","guid":{"rendered":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/?p=30858445"},"modified":"2019-11-04T12:00:20","modified_gmt":"2019-11-04T11:00:20","slug":"un-equipo-de-investigacion-multidisciplinar-liderado-por-la-upo-analiza-miles-de-genomas-de-la-iraquibacteria","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/ciencia\/2019\/10\/un-equipo-de-investigacion-multidisciplinar-liderado-por-la-upo-analiza-miles-de-genomas-de-la-iraquibacteria\/","title":{"rendered":"Un equipo de investigaci\u00f3n multidisciplinar liderado por la UPO analiza miles de genomas de la iraquibacteria"},"content":{"rendered":"
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Jer\u00f3nimo Pach\u00f3n, M\u00aa Eugenia Pach\u00f3n, Eugenio L. Mangas, Antonio J. P\u00e9rez-Pulido, Alejandro Rubio y Federico Divina<\/figcaption><\/figure>\n

El grupo UPOBioinfo<\/strong>, liderado por el profesor de la Universidad Pablo de Olavide Antonio J. P\u00e9rez-Pulido<\/strong>, junto al grupo de Enfermedades Infeccionas del Instituto de Biomedicina de Sevilla<\/strong> y el Hospital Universitario Virgen del Roc\u00edo<\/strong>, y a un equipo de investigadores del Data Science & Big Data Research Lab<\/strong> de la UPO, entre los que se incluyen Federico Divina y Miguel Garc\u00eda, emprendieron en 2018 el an\u00e1lisis de casi 2.500 genomas de A. baumannii<\/em>. El proyecto, enmarcado en la tesis de Eugenio L. Mangas, ha publicado los primeros resultados en la revista especializada de la Sociedad Europea de Microbiolog\u00eda, Microbial Genomics, <\/em>definiendo por primera vez el conjunto completo de genes que presenta la bacteria y distinguiendo dos tipos diferentes de cepas<\/strong>.<\/p>\n

\u201cPor un lado, existen cepas que contienen un menor n\u00famero de genes, lo cual podr\u00eda deberse a los sistemas de inmunidad que presentan. En particular, estas cepas contienen sistemas llamados CRISPR\/Cas, los cuales se conocen desde hace relativamente poco tiempo y precisamente permitir\u00edan a la bacteria \u2018defenderse\u2019 de la entrada de nuevos genes. El otro grupo de cepas no tiene apenas sistemas de inmunidad y eso parece que les ha permitido tener un mayor n\u00famero de genes, sobre todo provenientes de unas estructuras similares a minicromosomas, denominadas pl\u00e1smidos\u201d, explica Antonio J. P\u00e9rez Pulido. Estas cepas, hipot\u00e9ticamente podr\u00edan adquirir m\u00e1s f\u00e1cilmente genes de virulencia y resistencia a antibi\u00f3ticos, por lo que, como subraya el investigador, el control de estos sistemas de inmunidad bacterianos podr\u00eda suponer un arma muy poderosa en la lucha futura contra las infecciones de A.baumannii<\/em>.<\/p>\n

Durante el proceso de trabajo, para el an\u00e1lisis de los casi 2.500 genomas, seg\u00fan detalla Antonio J. P\u00e9rez Pulido, fue necesario el uso del supercomputador del Centro de C\u00e1lculo Cient\u00edfico de la UPO (C3UPO), cuyo administrador actual, Alejandro Rubio, puso en marcha diversos experimentos in silico<\/em>.<\/p>\n

A. baumannii, entre las bacterias para las que urge el desarrollo de medicamentos<\/strong><\/p>\n

\"The<\/a>
Filogenia molecular de bacterias del genero Acinetobacter analizadas en este trabajo. Cada nodo representa un grupo de genomas con el gen 16S ribosomal id\u00e9ntico (en verde), y diferente similitud de secuencia gen\u00f3mica (en rojo). Imagen: Microbial Genomics<\/figcaption><\/figure>\n

La Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud public\u00f3 en 2017 la lista de bacterias para las que urg\u00eda el desarrollo de nuevos medicamentos y dentro de ella, Acinetobacter baumannii<\/em> fue situada en el grupo de prioridad cr\u00edtica, junto con Pseudomonas aeruginosa<\/em> y la familia Enterobacteriaceae.<\/em> En concreto, A. baumannii <\/em>es una bacteria causante de infecciones oportunistas en ambientes hospitalarios. De hecho, esta bacteria es responsable de m\u00e1s del 10% de las infecciones intrahospitalarias, y causa diversas enfermedades como neumon\u00eda, bacteriemia, infecciones de la piel y tejidos blandos, endocarditis, infecciones del tracto urinario y meningitis secundaria, entre otras. Afecta sobre todo a individuos inmunodeprimidos u hospitalizados en las unidades de cuidados intensivos (UCI) y se estima que cada a\u00f1o produce un mill\u00f3n de infecciones en todo el mundo, causando alrededor de 15.000 muertes.<\/p>\n

La bacteria se puede diseminar a trav\u00e9s del aire a distancias cortas y a trav\u00e9s de la descamaci\u00f3n de la piel de pacientes colonizados. Pero el modo de transmisi\u00f3n m\u00e1s com\u00fan es a trav\u00e9s de las superficies y material hospitalario y, sobre todo, a trav\u00e9s de las manos del personal sanitario. La gran tasa de morbilidad y mortalidad que presenta A. baumannii<\/em> se debe principalmente a que es una bacteria multirresistente, encontr\u00e1ndose cepas que resisten a la mayor\u00eda de antibi\u00f3ticos utilizados habitualmente. Adem\u00e1s, hay que destacar que las infecciones de esta bacteria han aumentado desde que tuvo lugar la guerra de Iraq, y se cree que cepas infecciosas de esta bacteria provienen de heridas de soldados de esa contienda, lo que le ha llevado a que se la conozca desde entonces con el nombre de iraquibacteria.<\/p>\n

Art\u00edculo completo:
\n<\/strong>www.microbiologyresearch.org\/content\/journal\/mgen\/10.1099\/mgen.0.000309?originator=authorOffprint&identity=173007&timestamp=20201018162715&signature=befaf542e1c2788aaefd3782dfecb173<\/a><\/p>\n

Grupo UPOBioinfo
\n<\/strong>www.bioinfocabd.upo.es<\/a><\/p>\n

Data Science & Big Data Research Lab<\/strong>
\nhttps:\/\/datalab.upo.es\/<\/a><\/p>\n

Press Release in English<\/a><\/strong><\/p>\n

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El grupo UPOBioinfo, liderado por el profesor de la Universidad Pablo de Olavide Antonio J. P\u00e9rez-Pulido, junto al grupo de Enfermedades Infeccionas del Instituto de Biomedicina de Sevilla y el Hospital Universitario Virgen del Roc\u00edo, y a un equipo de investigadores del Data Science & Big Data Research Lab de la UPO, entre los que se incluyen Federico Divina y Miguel Garc\u00eda, emprendieron en 2018 el an\u00e1lisis de casi 2.500 genomas de A. baumannii. El proyecto, enmarcado en la tesis de Eugenio L. Mangas, ha publicado los primeros resultados en la revista especializada de la Sociedad Europea de Microbiolog\u00eda, Microbial Genomics, definiendo por primera vez el conjunto completo de genes que presenta la bacteria y distinguiendo dos tipos diferentes de cepas.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":30858446,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[3],"tags":[3566,1912,4919,2417,5715,406,218,5836],"class_list":["post-30858445","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia","tag-bacteria","tag-bioinformatica","tag-data-science-big-data-research-lab","tag-genoma","tag-hospital-virgen-del-rocio","tag-publicacion","tag-salud","tag-tesis"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30858445","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=30858445"}],"version-history":[{"count":9,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30858445\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":30858596,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30858445\/revisions\/30858596"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/media\/30858446"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=30858445"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=30858445"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=30858445"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}