{"id":30888634,"date":"2025-11-03T11:40:04","date_gmt":"2025-11-03T10:40:04","guid":{"rendered":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/?p=30888634"},"modified":"2025-11-11T19:31:56","modified_gmt":"2025-11-11T18:31:56","slug":"identifican-fuentes-de-inestabilidad-en-el-genoma-asociadas-al-cancer-con-una-nueva-herramienta-informatica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/ciencia\/2025\/11\/identifican-fuentes-de-inestabilidad-en-el-genoma-asociadas-al-cancer-con-una-nueva-herramienta-informatica\/","title":{"rendered":"Identifican fuentes de inestabilidad en el genoma asociadas al c\u00e1ncer con una nueva herramienta inform\u00e1tica"},"content":{"rendered":"
\"ilustraci\u00f3n
Imagen: Gerd Altmann (Pixabay)<\/figcaption><\/figure>\n

Un estudio internacional liderado por el investigador Pedro Mart\u00ednez, del Centro Andaluz de Biolog\u00eda del Desarrollo (CABD) \u2014centro mixto de la Universidad Pablo de Olavide (UPO), el Consejo Superior de Investigaciones Cient\u00edficas (CSIC) y la Junta de Andaluc\u00eda\u2014, ha empleado un enfoque de aprendizaje autom\u00e1tico en el estudio del genoma, centrado en los lugares donde se generan\u00a0 estructuras h\u00edbridas de ARN y ADN, asociadas a la inestabilidad gen\u00f3mica y al origen del c\u00e1ncer.<\/strong>\u00a0 Los resultados del estudio, publicados recientemente en la revista\u00a0NAR Genomics and Bioinformatics<\/a>, han permitido realizar predicciones espec\u00edficas en genomas de mam\u00edferos a trav\u00e9s de informaci\u00f3n de secuencia y se\u00f1ales de secuenciaci\u00f3n, contribuyendo en el avance de la comprensi\u00f3n biol\u00f3gica del genoma.<\/p>\n

\"De
Los investigadores Pedro Mart\u00ednez (i) y Federico Divina (d)<\/figcaption><\/figure>\n

El equipo de cient\u00edficos, compuesto por Thomas Vanhaeren y Federico Divina de la Universidad Pablo de Olavide de Sevilla, Ludovica Cataneo de la Universidad de Bologna y Pedro Mart\u00ednez del\u00a0Centro Andaluz de Biolog\u00eda del Desarrollo (CABD),<\/strong> ha realizado un enfoque bioinform\u00e1tico para estudiar la din\u00e1mica de los sitios en el genoma donde se originan los h\u00edbridos ARN-ADN, considerando las diferencias entre tipos celulares.<\/p>\n

Dentro de las c\u00e9lulas, la informaci\u00f3n gen\u00e9tica se encuentra en diversas formas como el ADN, el cual es capaz de copiarse en forma de ARN en un proceso que se conoce como transcripci\u00f3n. Si durante el proceso de transcripci\u00f3n se acumulan h\u00edbridos de ADN y ARN, se genera una fuente significativa de inestabilidad gen\u00f3mica asociada al origen del c\u00e1ncer. Estos investigadores han desarrollado una herramienta de aprendizaje autom\u00e1tico con un predictor de alta precisi\u00f3n, capaz de identificar \u00e1reas del genoma que presentan estas fuentes de inestabilidad<\/strong>. \u201cHasta ahora, las herramientas para predecir estos sitios se basaban \u00fanicamente en la secuencia de ADN, que es esencialmente la misma en todo el organismo, por lo que no era posible predecir la formaci\u00f3n de h\u00edbridos en tipos celulares espec\u00edficos. Nuestra herramienta hace uso de datos de secuenciaci\u00f3n masiva para generar mapas virtuales espec\u00edficos de tipos celulares y tejidos\u201d, indica Pedro Mart\u00ednez<\/strong>, investigador del CABD y uno de los autores del estudio.<\/p>\n

El estudio revel\u00f3 una alta precisi\u00f3n de esta herramienta en las predicciones.<\/strong> En base a ello, se generaron mapas virtuales en 51 sistemas de mam\u00edferos a partir de ENCODE, a los que la comunidad cient\u00edfica puede acceder f\u00e1cilmente ayudando al resto de investigaci\u00f3n a avanzar en su comprensi\u00f3n de la biolog\u00eda de estas estructuras asociadas al origen del c\u00e1ncer. \u201cLa alta precisi\u00f3n de nuestro predictor hace posible anticipar los sitios de formaci\u00f3n de h\u00edbridos de ADN y ARN sin necesidad de llevar a cabo los correspondientes experimentos de localizaci\u00f3n gen\u00f3mica, lo que puede facilitar el estudio de las bases moleculares de estas estructuras\u201d, culmina Pedro Mart\u00ednez.<\/p>\n

Referencia:<\/strong>
\nThomas Vanhaeren, Ludovica Cataneo, Federico Divina, Pedro Manuel Mart\u00ednez-Garc\u00eda, Enhancing R-loop prediction with high-throughput sequencing data<\/strong>, NAR Genomics and Bioinformatics<\/em>, Volume 7, Issue 2, June 2025, lqaf077, https:\/\/doi.org\/10.1093\/nargab\/lqaf077<\/a><\/p>\n

Fuente: CSIC Andaluc\u00eda<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Un equipo del Centro Andaluz de Biolog\u00eda del Desarrollo (CABD) y la Universidad Pablo de Olavide desarrollan una herramienta que permite predecir los sitios en el genoma donde se generan h\u00edbridos de ARN-ADN asociados al origen del c\u00e1ncer.<\/p>\n","protected":false},"author":6,"featured_media":30888635,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[3],"tags":[1912,43,4471,9318,2417,406,218],"class_list":["post-30888634","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia","tag-bioinformatica","tag-cabd","tag-cancer","tag-federico-divina","tag-genoma","tag-publicacion","tag-salud"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30888634","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/users\/6"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=30888634"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30888634\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":30888656,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30888634\/revisions\/30888656"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/media\/30888635"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=30888634"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=30888634"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.upo.es\/diario\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=30888634"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}