El desarrollo de proyectos que relacionen los genes que porta una determinada bacteria frente a la virulencia demostrada por la misma es de gran interés para la biomedicina. Conscientes de ello, el grupo de investigación de la Universidad Pablo de Olavide ‘UPOBioinfo’ dirigido por Antonio J. Pérez Pulido, en colaboración con el grupo de ‘Enfermedades Infecciosas’ del Instituto de Biomedicina de Sevilla, estudia los genomas de estas bacterias con la idea de encontrar posibles dianas terapéuticas.
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Un estudio ‘in silico’ de la UPO investiga las bases genéticas de la COVID-19
Investigadores de la Universidad Pablo de Olavide han llevado a cabo un estudio in silico empleando datos biomédicos de un modelo de ratón para investigar las bases genéticas de la enfermedad de COVID-19. El estudio ha sido realizado por un grupo multidisciplinar de investigadores de la UPO compuesto por Federico Divina, Miguel García y Domingo S. Rodríguez, y liderado por Fernando M. Delgado y Francisco A. Gómez. Todos los integrantes pertenecen a los grupos Data Science and Big Data Research Lab e Intelligent Data Analysis Group (DATAi) de la UPO.
La UPO ‘rebusca’ pequeños genes perdidos del genoma humano
Profesores de la Universidad Pablo de Olavide desarrollan AnABlast, una herramienta bioinformática para buscar pequeños genes perdidos en genomas secuenciados.
Un equipo de investigación multidisciplinar liderado por la UPO analiza miles de genomas de la iraquibacteria
El grupo UPOBioinfo, liderado por el profesor de la Universidad Pablo de Olavide Antonio J. Pérez-Pulido, junto al grupo de Enfermedades Infeccionas del Instituto de Biomedicina de Sevilla y el Hospital Universitario Virgen del Rocío, y a un equipo de investigadores del Data Science & Big Data Research Lab de la UPO, entre los que se incluyen Federico Divina y Miguel García, emprendieron en 2018 el análisis de casi 2.500 genomas de A. baumannii. El proyecto, enmarcado en la tesis de Eugenio L. Mangas, ha publicado los primeros resultados en la revista especializada de la Sociedad Europea de Microbiología, Microbial Genomics, definiendo por primera vez el conjunto completo de genes que presenta la bacteria y distinguiendo dos tipos diferentes de cepas.
El perfil de analista bioinformático está cada vez más demandado en los laboratorios de investigación
La bioinformática es una disciplina que permite analizar de forma automática la gran cantidad de datos biológicos que se generan día a día en los laboratorios mediante la aplicación de las nuevas tecnologías de la información. Para dar respuesta a esta demanda, desde la Universidad Pablo de Olavide se ha puesto en marcha recientemente la primera edición del Diploma de Especialización en Análisis Bioinformático.
Científicos del CABD desarrollan un programa bioinformático que identifica fragmentos ‘fósiles’ de genes
Los investigadores Juan Jiménez y Antonio Pérez-Pulido, del Centro Andaluz de Biología del Desarrollo han desarrollado una nueva estrategia in sílico para encontrar genes y fragmentos “fósiles” de genes en los genomas, incluso cuando esos genes o fragmentos no tengan parecido con otros genes conocidos, o estén tan fragmentados que no se identifiquen inicio y fin de su secuencia codificadora.
Sobresaliente Cum Laude para la tesis “Desarrollo de herramientas y protocolos bioinformáticos para la búsqueda de proteínas ortólogas y su aplicación en análisis evolutivos”
El pasado miércoles tuvo lugar en el Salón de Actos del Centro Andaluz de Biología del Desarrollo la defensa pública de la tesis doctoral titulada «Desarrollo de herramientas y protocolos bioinformáticos para la búsqueda de proteínas ortólogas y su aplicación en análisis evolutivos”, de la que es autor Pablo Mier Muñoz. Esta tesis doctoral, dirigida por el profesor Antonio J. Pérez Pulido, de la Universidad Pablo de Olavide, ha obtenido la calificación de Sobresaliente Cum Laude.
Un alumno de informática de la UPO, segundo en el Concurso de Ponencias en el XII Symposium de Bioinformática
Aurelio López Fernández, alumno de cuarto curso del grado en Ingeniería Informática en Sistemas de Información de la Universidad Pablo de Olavide, ha logrado el segundo puesto en el Concurso de Ponencias en el apartado de Estudiantes en el XII Symposium de Bioinformática, celebrado en Sevilla el pasado mes de septiembre en las instalaciones del cicCartuja. Este simposio, afiliado a la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB), reúne a científicos de múltiples disciplinas en torno a los nuevos descubrimientos computacionales relacionados con la bioinformática.