Investigación

Investigadores emplean la tecnología CRISPR-Cas para estudiar el papel del ARN en las primeras horas de desarrollo

Resumen de la tecnología CRISPR-Cas13d. A la izquierda se representan las distintas aproximaciones técnicas de la tecnología CRISPR-Cas13d usadas en este estudio y llevadas a cabo en las inyecciones de los embriones del pez cebra. En el medio se representa el modo de acción de la técnica donde el RNA diana es reconocido y cortado por el sistema CRISPR-Cas13d. A la derecha se representan alguno de los fenotipos que se han recapitulado o descubierto usando la tecnología CRISPR-Cas13d relacionados con la embriogénesis temprana en el pez cebra.

El profesor de la Universidad Pablo de Olavide, Miguel Ángel Moreno Mateos, investigador Ramón y Cajal en el Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD), co-lidera junto al investigador del Stowers Institute de EE.UU. Ariel Bazzini, un estudio basado en el empleo de la tecnología CRISPR-Cas para entender el papel que juega el ARN materno, depositado en el oocito, en las primeras horas del desarrollo. La investigación ‘CRISPR-Cas13d Induces Efficient mRNA Knockdown in Animal Embryos’ ha sido portada en la prestigiosa revista internacional Developmental Cell, publicada ayer lunes 28 de septiembre.

La herramienta de edición genética CRISPR-Cas actúa como unas ‘tijeras’ moleculares para cortar y pegar trozos de material genético en cualquier célula. Sin bien la mayoría de los sistemas CRISPR-Cas descubiertos hasta la fecha tienen como diana el ADN, recientemente se identificó un sistema nuevo, CRISPR-Cas13, capaz de cortar y eliminar el RNA.

Miguel A. Moreno Mateos, investigador del CABD

Este sistema fue primero implementado en sistemas ex vivo en cultivos de células de mamífero, y ahora en este trabajo ha sido optimizado por Miguel A. Moreno Mateos y su equipo en distintos modelos animales como el pez cebra o en ratones. “La tecnología que hemos implementado puede ser la base de muchas aproximaciones científicas y de muchas aplicaciones en biología y biomedicina”, afirma el investigador de la UPO, que destaca este trabajo no solo por la nueva herramienta que han perfeccionado si no por su futuro desarrollo tecnológico. Así, por ejemplo, esta herramienta se puede modificar para que, en lugar de cortar el ARN, Cas13 lo modifique o los investigadores sean capaces de localizarlo dentro de la célula, aproximaciones que ya han sido demostradas en sistemas ex vivo pero no en modelos animales.

En el trascurso de la investigación, Miguel Ángel Moreno Mateos destaca que no todos los sistemas CRISPR-Cas13 que funcionaban adecuadamente en células en cultivo después lo hicieron in vitro. “Al principio fue un poco desesperante porque probamos varias proteínas Cas13, como LwaCas13a, PspCas13b y PguCas13b, y ninguna parecía funcionar adecuadamente in vivo. Solo RfxCas13d demostró una buena eficiencia y especificidad” comenta el investigador. Por su parte, Ariel Bazzini, co-lider de este trabajo, afirma que “aunque existían tecnologías anteriores para eliminar o inhibir la función del RNA en animales, CRISPR-Cas13d es más eficiente y fiable, además de más económica que las que existen actualmente”.

Comprender cómo se inicia la vida

El trabajo parte de un objetivo claro, que es conocer qué factores maternos depositados en el oocito en forma de ARN mensajero, que dará lugar a proteínas, tienen un papel crucial en los primeros pasos de la vida. Esta herramienta es la base para estudiar, de manera sistemática, estos factores maternos y su papel durante el desarrollo temprano animal.

El objetivo es entender el papel que juega el ARN materno en las primeras horas del desarrollo

Y es que el laboratorio de Miguel Ángel Moreno combina el desarrollo de tecnología CRISPR-Cas in vivo con líneas de biología fundamental de desarrollo temprano. “Tratamos de entender cómo se inicia la vida, estudiar las funciones genéticas maternas y comprender cómo dichos factores maternos impulsan las primeras etapas de desarrollo”, explica el investigador, quien añade que “comprendiendo cómo arranca el desarrollo de un animal podemos entender mejor los mecanismos de la reprogramación celular que tanto impacto tiene hoy por hoy en biomedicina”. Así, esta herramienta podría contribuir, por ejemplo, al estudio de la infertilidad, la medicina regenerativa y los problemas de desarrollo en general.

Además, los resultados demuestran que la técnica se puede aplicar a una amplia gama de modelos acuáticos y terrestres, incluidos embriones de pez cebra, medaka, killifish y ratones.

El equipo del investigador Miguel Ángel Moreno es pionero en la optimización de la tecnología CRISPR-Cas13. De hecho, el estudio publicado en Developmental Cell es la base en la que se sustenta la primera fase de un proyecto de investigación financiado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas cuyo objetivo es destruir el genoma del coronavirus SARS–CoV-2 empleando la herramienta de edición genética de última generación CRISPR–Cas13d.

 

Referencia

Kushawah Gopal, Hernandez-Huertas Luis et al.CRISPR-Cas13d Induces Efficient mRNA Knockdown in Animal Embryos. Developmental Cell. (2020)

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👨‍💻 “No solo aprendemos a programar. Aprendemos a resolver problemas reales.”

📣 @99_pjlazar estudia 4º de Ingeniería Informática en Sistemas de Información en la UPO y ya está realizando sus prácticas en la empresa Soltel, donde aplica todo lo aprendido durante estos años.

💬 “La experiencia en la @eps.upo ha sido muy positiva. Contamos con personal docente apasionado por la enseñanza y cercano, que no solo explica contenidos, sino que se preocupa de verdad por que entendamos lo que estamos aprendiendo”.

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📚 Una de las claves que más valora es la metodología: “Nos alejamos del examen teórico tradicional y trabajamos cada vez más con evaluaciones prácticas, proyectos en grupo y simulaciones reales del entorno laboral. Esta forma de aprender no solo nos da conocimientos, también nos entrena para la realidad del sector tecnológico”.

⚙️ En Soltel, Pedro ha descubierto que los retos que parecía lejanos en clase ahora forman parte de su día a día: “Muchas de las tareas que realizo están directamente relacionadas con lo que he aprendido. Me he sorprendido aplicando cosas que no pensé que llegaría a usar fuera del aula”.

💡 ¿Y qué destaca de estudiar Ingeniería Informática en la UPO? “La capacidad para analizar, enfrentar y resolver problemas con creatividad. Esa es la competencia más valiosa para un ingeniero o ingeniera, y aquí la desarrollamos desde el primer curso”.

🎓 Eligió la UPO por el campus integrador, donde conviven distintas disciplinas, y se queda con el ambiente cercano y humano de la Escuela.

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